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10xGenomics Chromium單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄測(cè)序系統(tǒng)

  • 這真不是您需要的產(chǎn)品?
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    • 一個(gè)系統(tǒng),一套工作流程,強(qiáng)大的測(cè)序應(yīng)用? 10xGenomics公司推出了最新的Chromium?系統(tǒng)。利用上千萬(wàn)獨(dú)特的DNA序列標(biāo)記的GEMs,Chromium?系統(tǒng)可揭示重要的基因組信息。 1、全功能儀器10xChromiumController具有可伸縮的托盤(pán)和觸屏界面,占用空間極小,不超過(guò)1平方英尺,卻能夠高效的將10萬(wàn)到100萬(wàn)次的移液步驟自動(dòng)化,采用先進(jìn)的微流控系統(tǒng),高通量的對(duì)樣品進(jìn)行分離并帶上序列標(biāo)簽,最終達(dá)到高通量檢測(cè)的目的。10xChromiumController可以進(jìn)行基因組的分析,同時(shí)可以進(jìn)行單細(xì)胞水平的功能分析。 2、單細(xì)胞儀器10xChromiumSingleCellController具有可伸縮的托盤(pán)和觸屏界面,占用空間極小,不超過(guò)1平方英尺,卻能夠高效的將10萬(wàn)到100萬(wàn)次的移液步驟自動(dòng)化,采用先進(jìn)的微流控系統(tǒng),高通量的對(duì)樣品進(jìn)行分離并帶上序列標(biāo)簽,達(dá)到高通量檢測(cè)的目的。10xChromiumSingleCellController只可以進(jìn)行單細(xì)胞水平的功能分析。 產(chǎn)品優(yōu)勢(shì): 提升組裝參數(shù):結(jié)合該技術(shù)的組裝效果較單獨(dú)使用Illumina數(shù)據(jù)最高可提升十幾倍; 測(cè)序平臺(tái)通用性:應(yīng)用該技術(shù)構(gòu)建的文庫(kù)可與Illumina測(cè)序系統(tǒng)完美匹配; 分子片段長(zhǎng):分析可將短Reads組裝成長(zhǎng)達(dá)50-100Kb的linked-reads; 單倍體分析:可實(shí)現(xiàn)染色體級(jí)別Phasing,獲得精確的單體型信息。 技術(shù)原理: 1.將樣本分配到100,000s到1000,000s微反應(yīng)體系,每個(gè)微反應(yīng)體系含有一種特定的DNA序列標(biāo)記。 2.含有barcode信息的凝膠珠子首先與樣品和酶的混合物混合,然后與位于微流體“雙十字”連接中的油表面活性劑溶液結(jié)合。 3.GEMs (包含樣品、酶、凝膠珠子的混合物油滴)流到儲(chǔ)液器中并進(jìn)行收集。凝膠珠子溶解釋放barcode序列,開(kāi)始對(duì)樣本進(jìn)行標(biāo)記。將每個(gè)液滴中含有barcode信息的產(chǎn)物混合。然后構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)測(cè)序文庫(kù)。 應(yīng)用方向: 1.基因組組裝:利用GemCode平臺(tái)對(duì)長(zhǎng)片段序列進(jìn)行擴(kuò)增引入barcode序列以及測(cè)序接頭引物,然后將序列打斷成適合測(cè)序大小的片段進(jìn)行測(cè)序,通過(guò)barcode序列信息將多個(gè)Reads進(jìn)行組裝,獲得跨度在30-100Kb的linked-reads信息,從而獲得大片段的遺傳信息。 優(yōu)勢(shì): 通過(guò)該技術(shù)構(gòu)建的文庫(kù)可與Illumina測(cè)序系統(tǒng)完美匹配,將短Reads組裝成長(zhǎng)達(dá)100Kb的片段; 結(jié)合該技術(shù)后組裝效果較單獨(dú)使用Illumina數(shù)據(jù)最高可提升十幾倍; 精度高、成本低,操作難度小。 2.單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序:基于10x Genomics最新Chromium?系統(tǒng)利用油包水的微反應(yīng)體系,通過(guò)序列標(biāo)簽區(qū)別群體中的不同細(xì)胞,獲得單細(xì)胞水平的數(shù)字化基因表達(dá)譜,可實(shí)現(xiàn)數(shù)千甚至數(shù)萬(wàn)個(gè)單細(xì)胞群體分析,解決常規(guī)scRNA-seq方法在通量或擴(kuò)展性方面存在的不足,為單細(xì)胞研究開(kāi)拓新的思路。 優(yōu)勢(shì): 超高通量:?jiǎn)蝹€(gè)樣本細(xì)胞檢測(cè)數(shù)最高可達(dá)1000-10000; 項(xiàng)目周期短:一天內(nèi)即完成從細(xì)胞懸液到cDNA文庫(kù)構(gòu)建所有的測(cè)序準(zhǔn)備工作; 細(xì)胞捕獲效率高:?jiǎn)蝹€(gè)細(xì)胞捕獲效率高達(dá)65%,可準(zhǔn)確鑒別稀有細(xì)胞類(lèi)型; 真正的單細(xì)胞測(cè)序:通過(guò)油滴-barcode-單細(xì)胞的對(duì)應(yīng)關(guān)系,實(shí)現(xiàn)真正意義上的單細(xì)胞測(cè)序; 測(cè)序平臺(tái)兼容度廣:與Illumina各種型號(hào)的平臺(tái)高度兼容。

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