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檢測認證人脈交流通訊錄
  • 基因測序技術(shù)服務(wù)

  • 這真不是您需要的服務(wù)?

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  • 對應(yīng)法規(guī):相關(guān)標準
    CNAS認可項目:否
  •   1、常規(guī)測序

      常規(guī)測序:采用ABI 3730XL測序儀進行測序,有效讀長可達800bp以上/反應(yīng)

      樣品要求:基因組DNA、PCR擴增產(chǎn)物、菌液、質(zhì)粒DNA等

      結(jié)果形式:電子郵件發(fā)送序列文件

      完成周期:24-48小時

      2、二代測序技術(shù)服務(wù)

      1)基因組de novo測序:用于獲得物種的全基因組序列圖譜,同時為后續(xù)研究提供參考序列。

      實驗要求:

      1、客戶需提供待測樣本及相關(guān)信息(組織樣品,質(zhì)量不少于10g;提取的基因組DNA:產(chǎn)量≥100mg,濃度≥50ng/ul;OD260/280值介于1.8~2.0之間;確保DNA無降解,無污染。DNA可分步提供)。

      2、客戶應(yīng)提供相應(yīng)的背景材料,包括:樣本描述,預(yù)測基因組大小,分析要求等。

      結(jié)果形式:

      提供項目實驗報告和分析報告:實驗報告包括簡單的操作流程、試劑使用等情況;分析報告包括:基因組survey、組裝結(jié)果、基因結(jié)構(gòu)分析、重復(fù)序列分析、基因功能分析、比較基因組學(xué)分析、非編碼RNA分析。

      完成周期:根據(jù)基因組復(fù)雜程度而定。

      2)基因組重測序:用于在全基因組范圍內(nèi)進行變異檢測(Indel,SNP)、進行群體進化分析、進行遺傳圖譜構(gòu)建。

      實驗要求:

      1、客戶需提供待測樣本及相關(guān)信息(組織樣品,質(zhì)量不少于5g;提取的基因組DNA:產(chǎn)量≥20ug,濃度≥50ng/ul;OD260/280值介于1.8~2.0之間;確保DNA無降解,無污染。)。

      2、客戶應(yīng)提供相應(yīng)的背景材料,包括:樣本描述,實驗?zāi)康?,必要的相關(guān)實驗設(shè)計內(nèi)容,分析要求等。

      結(jié)果形式:

      提供項目實驗報告和分析報告:實驗報告包括簡單的操作流程、試劑使用等情況;分析報告包括:數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計和評估、Mapping情況統(tǒng)計、SNP/INdel Calling分析、nsSNP-containing基因定位和功能注釋、相近物種進化分析等。

      完成周期:質(zhì)檢合格后40個工作日內(nèi)完成。

      3)轉(zhuǎn)錄組測序:用于基因表達差異分析(質(zhì)和量)、發(fā)掘新基因、進行RNA編輯分析。

      實驗要求:

      1、客戶需提供待測樣本及相關(guān)信息(組織樣品,質(zhì)量不少于5g;提取的總RNA:產(chǎn)量≥10ug,濃度≥50ng/ul;OD260/280值介于1.8~2.0之間;確保RNA無降解,無污染。)。

      2、客戶應(yīng)提供相應(yīng)的背景材料,包括:樣本描述,實驗?zāi)康模匾南嚓P(guān)實驗設(shè)計內(nèi)容,分析要求等。

      結(jié)果形式:

      提供項目實驗報告和分析報告:實驗報告包括簡單的操作流程、試劑使用等情況;分析報告包括:對于有參考基因組序列的轉(zhuǎn)錄組分析包括:數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計和評估、基因表達差異分析、差異表達基因GO富集分析、KEGG分析、SNP/Indel篩選、新基因查找、剪切位點統(tǒng)計、蛋白網(wǎng)絡(luò)互作等。對于無參考基因組序列的轉(zhuǎn)錄組分析包括:數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計和評估、de novo組裝結(jié)果、污染檢測、基因表達及差異分析、差異表達基因GO富集分析、KEGG分析、基因互作網(wǎng)絡(luò)分析、新轉(zhuǎn)錄本查找與LncRNA預(yù)測。

      完成周期:質(zhì)檢合格后40個工作日內(nèi)完成(如果增加分析要求,時間順延)。

      4)Small RNA測序:用于miRNA表達模式分析、miRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和靶點、發(fā)掘生物標記物。

      實驗要求:

      1、客戶需提供待測樣本及相關(guān)信息(組織樣品,質(zhì)量不少于5g;提取的總RNA:產(chǎn)量≥50ug,濃度≥50ng/ul;OD260/280值介于1.8~2.0之間;小RNA:產(chǎn)量≥20ug,濃度≥200ng/ul;OD260/280值介于1.8~2.0之間;確保RNA無降解,無污染。)。

      2、客戶應(yīng)提供相應(yīng)的背景材料,包括:樣本描述,實驗?zāi)康?,必要的相關(guān)實驗設(shè)計內(nèi)容,分析要求等。

      結(jié)果形式:

      提供項目實驗報告和分析報告:實驗報告包括簡單的操作流程、試劑使用等情況;分析報告包括:數(shù)據(jù)質(zhì)控、參考序列比對、小RNA分類、rRNA,tRNA,snRNA,repeat sRNA和snoRNA鑒定、靶基因預(yù)測、堿基偏好性分析、差異表達分析、GO富集分析、KEGG分析、蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析。

      完成周期:質(zhì)檢合格后40個工作日內(nèi)完成(如果增加分析要求,時間順延)。

      5)全外顯子組測序:用于經(jīng)濟高效發(fā)掘外顯子區(qū)的致病位點及易感位點,發(fā)現(xiàn)稀有突變。

      實驗要求:

      1、客戶需提供待測樣本及相關(guān)信息(組織樣品,質(zhì)量不少于5g;提取的基因組DNA:產(chǎn)量≥50ug,濃度≥50ng/ul;OD260/280值介于1.8~2.0之間;確保DNA無降解,無污染。)。

      2、客戶應(yīng)提供相應(yīng)的背景材料,包括:樣本描述,實驗?zāi)康?,必要的相關(guān)實驗設(shè)計內(nèi)容,分析要求等。

      結(jié)果形式:

      提供項目實驗報告和分析報告:實驗報告包括簡單的操作流程、試劑使用等情況;分析報告包括:數(shù)據(jù)質(zhì)控、與參考序列進行比對、統(tǒng)計測序深度及覆蓋度、SNP/Indel檢測、注釋及統(tǒng)計、Somatic SNP/Indel檢測、注釋及統(tǒng)計。

      完成周期:質(zhì)檢合格后40個工作日內(nèi)完成(如果增加分析要求,時間順延)。

      6)甲基化測序:用于獲得單堿基精確度的全基因組DNA甲基化圖譜。

      實驗要求:

      1、客戶需提供待測樣本及相關(guān)信息(DNA樣品總量≥5ug,DNA樣品濃度≥150ng/ul)。

      2、客戶應(yīng)提供相應(yīng)的背景材料,包括:樣本描述,實驗?zāi)康?,必要的相關(guān)實驗設(shè)計內(nèi)容,分析要求等。

      結(jié)果形式:

      提供項目實驗報告和分析報告:實驗報告包括簡單的操作流程、試劑使用等情況;分析報告包括:數(shù)據(jù)質(zhì)控、參考序列比對、C位點覆蓋度統(tǒng)計、全基因組甲基化水平分析、甲基化位點檢測、差異甲基化區(qū)域分析、比對率統(tǒng)計、測序深度統(tǒng)計、染色體水平甲基化密度分布、不同基因組功能元件甲基化分布、CpG、CHG、CHH甲基化比例統(tǒng)計、功能注釋及富集分析等。

      完成周期:質(zhì)檢合格后40個工作日內(nèi)完成(如果增加分析要求,時間順延)。





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